在闯过连任确认关之后，伯南克在即将于２月１日开始的新任期之内至少面临三方面艰巨挑战。
首先是退出政策的实施。美联储在应对金融危机的过程中发挥了至关重要的作用，而今在金融市场逐渐恢复稳定、经济开始走向复苏之际，伯南克所面临的最大挑战正是如何对自己以前政策的反向操作，即退出政策。美联储为应对危机采取的政策工具大部分将于今年２月底或３月底到期，尤其值得关注的是何时提息以及１．２５万亿美元的房地产抵押贷款支持债券收购计划是否会延期。目前美国经济复苏势头依然脆弱，市场尤其是房地产市场对美联储深度依赖，退出政策的实施处于两难。退出过早，会打击经济复苏，可能造成第二次衰退；退出过晚，则可能引发未来危机。
其次是金融监管改革。金融危机发生以来，加强金融监管成为普遍呼声。奥巴马日前提出加强金融监管改革新规，限制大银行的规模和交易活动。这一思路与伯南克救助金融体系的措施有很大差异。此外，作为美国主要的金融监管者之一，美联储自身也已成为被改革的一部分。在尚未完成的金融监管改革立法进程中，美联储的角色是争议的一大焦点。参议院银行委员会主席克里斯托弗·多德提议取消美联储监管银行的职责，使其专注于货币政策。伯南克对此坚决反对，并多次强调美联储在金融监管中的专业技能及金融监管与货币政策不可分割的关系。
再次是保持美联储的独立性。作为中央银行，美联储的独立性向来被奉为其核心价值。但在当前的美国经济和政治形势下，美联储的独立性正受到前所未有的挑战。《纽约时报》２８日一篇评论把伯南克比作政治足球，《华尔街日报》此前的一篇评论则把伯南克比作美国两党斗争的“拳击沙袋”。美国国会去年１１月通过一项法案，要求对美联储进行审计。
在就业形势依然严峻的背景下，如何推动美国经济走上可持续复苏之路，伯南克面临的挑战才刚刚开始。
