据台湾媒体报道，“蔡小英胜选就特赦陈水扁？！”这个传闻在这场选举中，持续发烧，而蓝营更以此大作文章，向支持者诉求“千万不能让蔡英文当选，否则贪腐的陈水扁就会被放出来”云云；对于是否特赦扁，民进党主席蔡英文接受访问时，依旧拒绝明确表态。
蔡英文在11月24日接受英国广播公司(BBC)中文网专访时，再度被问到她对陈水扁的看法。她表示，陈水扁对台湾民主进程有贡献，其执政终结了国民党长期的一党专政，陈水扁在执政时的一些政策也照顾了老年人、农民、劳工等群体。
另外，蔡英文也承认“陈水扁有一些个人的问题”，她说，民进党对此的态度很明确，就是希望以司法来公正解决这些问题。
至于敏感的特赦阿扁议题，蔡英文在访问中，拒绝明确表示如果在胜选上台后是否会赦免陈水扁；她重申，会根据当时的民意诉求来决定是否对审讯陈水扁的过程进行司法覆核，如果发现在司法程序上的确发现不当之处的话，才会决定如何处理陈水扁。
今年4、5月间，国民党籍“立委”邱毅指称蔡英文在党内初选时，曾经承诺假如当选，就会特赦陈水扁。邱毅直指，蔡英文为寻求阿扁嫡系子弟兵与扁迷支持，在今年4月初通过民进党发言人郑文灿赴桃园龟山监狱特见阿扁时，向扁表达蔡对特赦阿扁的正面态度，并达成“一旦当选就特赦阿扁”的秘密期约。对此问题，蔡英文当时以“应关注更重要的事”回避媒体询问。
今年8月25日公布“十年政纲─司法改革篇”时，蔡英文再度被追问如果2012当选，是否特赦陈水扁？当时蔡英文则说，“这是政治议题，另外找时间再处理”。
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