香港《大公报》今日发表评论员署名文章指出，虽然马英九上任后进行了台军方的治理改革，但是台军仍然是重疾缠身，有“五大危机”尚不得治。
文章摘录如下，
台军迄今仍然面临“五大危机”：一、信仰危机，官兵不知为何而战；二、贪腐弊案危机，军中伦理道德荡然无存；三、军纪松弛涣散危机；四、将官多士兵少的危机；五、兵源危机，社会青年不愿当兵。
据岛内媒体报道，今年2月，一名台湾空军499联队的幻象战机飞行官，吸食K他命毒品后，驾驶战机升空执行任务。侥幸当时毒瘾没有发作，否则就让台湾最昂贵的幻象战机成为“摇头机”而机毁人亡，后果不堪设想。该飞行官坦承，因“压力过大”、“精神空虚”而吸毒。这种冒著生命危险“上天”的做法，恐怕在世界飞行史上是罕见的。台军高层对此事极为震惊。此事虽是个案，但反映了台军官兵素质和台军建设的种种危机。
马英九上台后，在坚持“九二共识”基础上，主张维持“不统、不独、不武”台海现状，加强台军建设，提升战力，以便在与大陆谈判时占据有利地位。因而马英九采取各种方法和举措，针对陈水扁执政时给台军留下的“以武谋独”的“后遗症”──种种危机，进行解危除困。但台军迄今仍然面临“五大危机”：
一、台军面临信仰危机，官兵不知为谁而战，为何而战。
在国民党“两蒋”时期，台军坚持“一个中国”原则，在台军中进行反“台独”教育。然而，陈水扁上台后，正式下令在台军中取消坚持多年的反“台独”教育，而代之以搞“台独”教育，妄图把台军打造成名副其实的“台独”军队。千方百计对台军从思想上进行彻底改造，不断在台军中进行“拥扁”、“拥政”、“爱台”教育；不断向官兵灌输其“统一不是唯一选项”、“两岸无九二共识”、“中共仍然是威胁台湾安全的敌人”、“与大陆作战是台军的主要任务”等分裂意识。特别是2007年，陈水扁明确提出，台军官兵要为“台湾的生存与发展而战、为台湾的自由民主而战、为台湾的百姓福祉而战”，并以此作为军魂，对官兵进行“洗脑”、“涮心”。这使台军官兵在“统独”问题上产生极大的思想混乱和迷失，产生了信仰危机。
马英九上台后，在坚持“九二共识”的基础上，主张维持“不统、不独、不武”台海现状，以此对台军官兵进行思想教育，加强军队建设。但迄今对陈水扁力主搞“台独”的思想理念并未清除，信仰危机仍然在台军官兵的头脑中存在，为谁而战，为何而战的问题并未完全解决。
