4月14日，台湾地区候任领导人马英九接受香港媒体联访时，正式宣布“海峡交流基金会”（以下简称“海基会”）董事长一职，将由国民党副主席江丙坤出任。5月20日马英九就职后，在“陆委会”的授权下，将由海基会负责与大陆海峡两岸关系协会（以下简称“海协会”）协商。
马英九证实江丙坤将担任台湾海基会董事长(图)
4月14日，江丙坤表示，接下新职责任重大，未来将全力以赴，未来将致力于两岸经贸正常化，协助马英九落实发展经济的选举政见。
江丙坤欣然接受海基会董事长新职 称将全力以赴
江丙坤：两岸权益工作会谈520后将移交海基会
5月7日江丙坤表示，两岸经贸正常化是未来台湾海基会的重要工作，他建议优先选择对台湾有利，或是对两岸都有利的项目先行开放，各有利弊的项目最后协商。
江丙坤表示将优先推动开放对两岸都有利的项目
5月26日，台湾海基会举行临时董监事会，通过高层人事案。推举国民党副主席长江丙坤为新任董事长，补选台当局前“陆委会副主委”高孔廉为副董事长。江丙坤在致词表示，“海基会”在两岸交流中具有无可取代的位置，辜汪会晤也为两岸发展建立坚实基础，未来希望能在所有董监事的共同努力下，为两岸正常化创造更有利条件。谈及未来工作内容，江丙坤表示，未来重心将放在经贸往来、文化交流的全面正常化上以及保障台商权益。江丙坤在董监事会后发布两项人事，由高孔廉兼任海基会秘书长，及前“立委”庞建国出任海基会副秘书长。
台湾海基会今将举行临时董监事会 通过高层人事案
国民党副主席江丙坤正式出任台湾海基会董事长
江丙坤表示高孔廉将出任海基会秘书长
陈正然、萧美琴、李进勇三人增补为台海基会董事
5月26日，台当局“陆委会”正式授权海基会，就周末客、货运包机和大陆游客赴台观光等3项议题与大陆海协会展开协商。
台当局“陆委会”正式授权海基会与海协会协商
5月29日，海协会致函海基会，邀请海基会董事长江丙坤、副董事长兼秘书长高孔廉访问北京，就两岸周末包机、大陆居民赴台旅游事宜进行商谈。 江丙坤5月29日上午表示接受海协会的邀请。
海基会董事长江丙坤、副董事长兼秘书长高孔廉于6月11日至14日率团访问北京，大陆海协会和台湾海基会6月12日正式重启协商谈判，12日上午，海协会会长陈云林与海基会董事长江丙坤在北京钓鱼台国宾馆举行商谈。这是两会领导人10年来的首次会谈，标志着中断近10年的两会制度化协商正式恢复。
6月13日上午9时，海协会会长陈云林与海基会董事长江丙坤，在北京钓鱼台宾馆就两岸周末包机与大陆居民赴台旅游事宜签署协议文本。
历史性的一刻 海协会与海基会领导人再握手(图)
海协会海基会就两项协商议题签署协议文本
10月28日，台湾海峡交流基金会举行第六届董监事第三次临时联席会议，会中选举第七届董监事名单，董事名额首度增设6名，由过去43席增加为49席。其中“政府代表”增加4席，政党代表减少1席，社会贤达减少1席，企业捐助实际增加7席。
台湾海基会董监事改选 董事名额由43席增加为49席
11月4日下午，海协会会长陈云林与海基会董事长江丙坤在台北签署了《海峡两岸空运协议》《海峡两岸海运协议》《海峡两岸邮政协议》和《海峡两岸食品安全协议》四项协议。这宣告两岸同胞盼望已久的两岸直接通航、通邮即将变成现实。
两会签署四项协议 两岸“三通”大步迈进
12月2日，台湾海基会举行第7届第一次董监事会，推举江丙坤续任董事长，高孔廉、台大陆事务部门副主管傅栋成与金仁宝董事长许胜雄出任副董事长。高孔廉并兼任海基会秘书长。
台湾海基会下午举行董监事会 江丙坤续任董事长
海峡交流基金会”（简称“海基会”）于1990年11月21日成立，1991年3月9日举行开幕式，正式挂牌运行。辜振甫担任首任董事长，该会内设秘书处，文化服务处、经贸服务处、法律服务处、旅行服务处及综合服务处等6个业务单位，主要功能是接受“陆委会”委托，办理两岸交流所衍生的各项事务。
“海基会”依章程规定董事会为基金会之决策机构，掌理基金筹募、保管及运用，秘书长任免，工作方针核定，业务计划及预算审议等事宜。董事会设董事长一人、副董事长一至三人。
