6月16日，台军陆军军官学校举行84周年校庆，台湾地区领导人马英九首次以“统帅”身份视察“三军”，并领唱被民进党禁了8年的原黄埔军校校歌。台湾陆军军官学校的前身是孙中山先生一手创办的黄埔军校，在1949年随国民党溃退到台湾。此后，陆军军官学校一直是岛内为国民党培养军事干部的基地。在陈水扁掌权台湾的8年中，陆军学校遭到降级，该校出身的将领和原黄埔系人马均遭受打压，取而代之的是扁系将领的鸡犬升天。如今马英九现身校庆，台湾媒体认为这是给予军校的高规格礼遇，“黄埔精神”将重新得到认同。
　　黄埔老将闻歌泪下

　　校庆前夜，马英九便来到位于高雄凤山的陆军学校黄埔宾馆住下，成为第一位在此过夜的“三军统帅”。16日清晨5点30分马英九就起床了，但原本和军校学生一起晨跑的计划，因大雨而改为在游泳池“晨泳”。为了降低所谓的“威权象征”，马英九没有像过去的陈水扁一样安排阅兵，而是把庆祝典礼移到室内举行。

　　可能是由于从政以来很少和军队打交道，马英九在校庆典礼上动作显得比较生涩。在带领部队高喊口号时，马的举手动作明显慢了一拍，就连典礼到了那一段该站那里，马英九都有点搞不清楚。当典礼即将进行完毕，校庆司仪说“礼成”的时候，马英九急急忙忙要走。可是按照程序，马英九应先转身向孙中山遗像鞠躬，再转回来等现场指挥官带领部队向他行礼之后才能离开。幸亏指挥官很机警，喊了一句“请受礼”，马英九赶紧又走了回来，向孙中山像鞠躬，并接受台下人的致敬。

　　庆典过程中，“黄埔”二字始终是活动的核心。包括台前“行政院长”郝柏村、前“陆军总司令”黄幸强上将等黄埔校友皆共同参与。此外，陆军官校27期校友也以毕业50周年校友身份返校。当马英九带领全场高唱黄埔校歌时，不少黄埔老将随着音乐潸然泪下。

　　另外值得注意的是，由于两岸关系改善，马英九在庆典当中向台军官兵讲话时，没有提大陆解放军的“威胁”，而是用“吓阻任何侵略的‘国防’的力量”的提法，取代台军过去的假想敌——解放军。同时，马英九还表示台当局要展现成为“和平缔造者”的决心。

　　陈水扁打压黄埔系

　　台陆、海、空三军官校是台军培养军官最重要的摇篮，台军中的绝大多数军官出自这三所学校。其中，陆军军官学校因继承了前黄埔军校的体制，因此在“两蒋”时期该校毕业生一如当年“黄埔系将领”，受到台湾当局的青睐，成为一股重要的政治力量。

　　但陈水扁上台后，为了在军中培植自己的势力，一步步在军队中去除国民党的影响，在军队人事方面采取打压陆军军官学校及其毕业生的手段。陈水扁首先调降了“三军”军官学校的级别。把台三军官校校长的军衔从中将降为少将。而台军原政战系统，由于是国民党在军队中的政工系统级别也被降低，“政战主任”的军衔从少将降为上校。

　　而另一方面，曾担任陈水扁办公室的侍卫长的申伯之，由于与陈水扁的关系相当密切，被一路破格升任“海军副司令”。2005年12月13日，陈水扁不顾军中其他将领的反对，强行任命只有少将军衔的申伯之担任“海军官校校长”。之后，申伯之晋升海军中将，继而升任“海军副司令”。陈水扁在军队里大搞任人唯亲、拉一派打一派的做法，让台军的许多将领十分不满。

　　纵观陈水扁任内的几位国防部长，只有汤曜明毕业于陆军官校第28期，其他几人如伍世文、李杰均出身海军，李天羽出身空军，到了最后一任蔡明宪就更离谱了，毕业于台湾大学法律系。