国民党与亲民党版的“直航条款”主要对“两岸人民关系条例”中的第28、29条做出修正，旧条文中这两条的规定是“台湾的船舶、航空器及其它运输工具，经主管机关许可，如航行至大陆地区。其许可及管理办法，由台湾交通主管部门会同有关机关拟订，报请台湾行政机构核定；如需延长在大陆停留时间，须向台湾立法机构报告备查后，可以延长。”
而修改后的“直航条款”的内容是，台湾地区船舶、飞机及其他运输工具，可航行至大陆地区；而大陆地区的船舶，飞机及其他运输工具，得经许可，也可进入台湾地区。修正案还要求删除第30条有关禁止外籍船舶、飞机在两岸港口或机场航行的规定，全面准许外籍运输工具在两岸之间自由通行。
谢郁对“直航条例”和修改之后的“直航条款”的内容解释说，从法规和法律的角度来说，如果两岸“直航条款”通过以后，大陆地区的船舶航空器可以直接进入台湾的港口和机场，就是意味着“两岸直航”的合法性，和它的已经完全被许可。那么我们其实看到，在修改前后的“两岸直航的条款”，其实它透露出来的这个政策意向和政策的信息是完全不一样的，首先第一个我们看到，在此前规定是台湾地区的船舶和航空器和其他运输工具未经许可不得进入大陆地区，那么现在改成说，经许可可以进入。原来是说，常态就是禁止的，只有个案是许可的，修改以后变成一个常态就是许可的，常态、正常是可以许可的，只有个案不许可的，它的这个开放性和松绑性是完全不一样的。那么关于第二个就是，大陆地区的航空器船舶和其他运输工具，经许可可以进入台湾地区。我想这一条呢，到现在目前来说，在攻防过程中，基本上是障碍不是很大的了，现在还有一个两岸“直航条款”里面的第30条，就是说关于这个外籍的船舶航空器航行两岸之间的这一条，现在恐怕还是一个很大的变数，我想所以现在两岸“直航条款”虽然经过修改，这样长期的攻防，它最后要达到什么样的一个状况，其实这里面，还存在着一些变数。
刘红则对此评论说，即使国亲版的这个修改意见通过的话，现在恐怕也不能这么乐观的说，“三通”问题就取得了很大的突破，因为就“三通”来讲，就是在这个《两岸人民关系条例》里面，他也是允许的，所以泛蓝现在也是抓住了这一点来要求修改第28、29条，最大的区别就是说以前是要同意，现在就是说，除了大陆的船、大陆的飞机去台湾需要同意之外，台湾的船、台湾的飞机到大陆来就不需要同意，所以差别是在这儿，泛蓝之所以这样强调，也是根据他现有的规定和文件，提出的这个修改版本，那么也就是说，现在的真正的症结而不是《两岸人民关系条例》里面原有的规定的问题，而是民进党当局他根本就是拒绝“三通”的问题，拒绝直航的问题，所以说即使这个版本通过以后，也不会，恐怕也不会马上就带来“三通”的这个局面，因为有民进党当局这个最大的阻力存在。
谢郁则评论说，我想作为民进党当局，现在他其实他们看到了，要在立法机构阻挡这个两岸“直航条款”过关，挡得了一时也挡不了永久，终归是要过的。因为以泛蓝现在的实力，他现在掌握着立法机构里面的多数的席次的势力来说，要想推动是早晚的事，另外一个从长期来看，民意所至，民心所向，你长期这样阻挡这个条款的过关，你只会让你政党形象、声望、支持度更进一步滑落，所以我想民进党当局很清楚，包括陈水扁他很清楚，要挡这个条款永远挡是不可能的，所以其实他们在私下做好了，即便你这个条款过了，我也有我反制的这个措施，所以我们看到这两天前，看到从12日开始，泛蓝甲级动员要在“立法院”推这个过的时候台湾的行政部门有一些官员就出来说了，即使条例过了，当局是不是具体把它落实还要看，看什么呢？他提出来的理由，他就说，这个是个两岸协商的问题，不是说台湾说了要怎么样，就怎么样。前两天国民党的主席马英九就说了，即便是这一次过关了，修法成功了，那么如果执政当局他不做，你也没办法，但是我们看到如果是这样的一个结果出现，必然他就会引起后续的一个效应，首先第一个，如果它在法律上都已经有它的合法性了，那么你执政当局不管是你用什么样的借口来拖延，或者来阻止它的实施和落实，首先第一个，就突显了你执政团队，执政当局的这个不合理性和不合法性，因为你跟现在的台湾立法机构，正式通过的法律条文是相背，或者说是拖延的，或者说是没有按照条文来落实的，突显你的不合理性，这是第一个。第二个，我想，民意在这个里面，对执政当局的反弹和抵触的这种心态，会进一步加剧。
如果台湾当局的一些人，执意来违反民意的话，会带来一些特别负面的影响。不管是陈水扁个人的声望还是整个民进党政党的支持度，已经降到他上台以来的最低点了，十几个百分点，如果他一而再，再而三还在两岸交流中人为设限的话，其实明显的，就是以自己政党的利益或者以个人的权位利益来考量，而放弃掉绝大多数社会的效益和民众利益的这种政策走向，显然很背离这个客观形势的，这种情况下，只会让他自己的政党执政基础更加削弱。
（资料来源：央视国际）
