吉林大学校长展涛等人指出，大陆对 与台湾开展教育交流与合作持积极鼓励的态度，１９８５年，大陆就放开台湾学生报考大陆高校。２００６年，又宣布开放承认台湾学历。２００７年，教育部有关负责人宣布欢迎台湾院校到大陆招生。２００７年，大陆高校招收台湾学生２２３５名，在校的台湾学生达到６８５８人。两岸有４００多所高校签署了交流协议，每年有２０００至４０００名台湾学生到大陆考大学，报考硕士、博士的台湾学生呈现持续增长的态势。

    但另一方面，受复杂因素的影响，从１９９８年至２００７年，台湾在对大陆开放教育交流与合作方面，却明显滞后，连早期颁布的《大陆地区学历检核及采认办法》也全面搁浅。厦门大学台湾研究院张宝蓉博士说，从２００８年开始，台湾开始放松限制，但又采取“三限六不”政策：限制承认大陆高校数量、限制陆生来台数量、限制医师学历承认；大陆学生来台考试不加分、不提供奖学金、不许到校外打工或兼职、不能享受健康保险、不能报考专业证照、毕业后不能继续留在台湾就业。这个政策受到两岸许多人士的质疑。

    两岸不少学者认为，产生上述现象的原因，既有政治因素，也有人为顾虑。台湾国政研究基金会教育文化组召集人李建兴认为，在全球化的时代，高等教育已经成为一个高度竞争的领域。教育的专业化、国际化、自由化已经成为成为无可避免的趋势。大陆和台湾只有强化和深化学术内涵，拓展学生的视野，才能在国际竞争中取得优势地位。李建兴认为，在海峡两岸深化和拓展教育交流与合作，对两岸学生而言，可以选择适才适所的学校就读，可以获得多元化的升学和进修管道。对学校而言，可以调节供需失调，促进学校发展。目前台湾各大高校，生源不足，招生困难；而大陆高校，供不应求，每年有数百万学子望高校之门兴叹，选择开放，适当调节，对两岸高校都有利。对企业而言，可以通过两岸教育交流和相互采认学历，扩大企业的选材范围，增强企业的“体质”，增加企业产学合作的机会，有利于新产品特别是高科技领域的创新和开发。对社会而言，则能提高两岸民众素质，解决民众因婚姻或就学伴随而至的升学与就业问题。此外，两岸学生往来就学，在学习中增进对彼此生活、制度和价值观的了解，有助于消除歧见，对两岸长久和平发展非常有利。

    厦门大学台湾研究院张宝蓉博士通过研究还发现，台湾开放高校赴大陆招生，有利于解决台湾高等教育经费投入不足的问题。她说，近些年，台湾教育经费投入占ＧＤＰ的比例，连年走低，已经从２００１年的６．０９％降至５．７６％。２００８年，受全球金融危机的影响，台湾高等教育公务预算经费维持在７６．８亿元新台币的低位，２００９年高等教育行政和督导预算经费只有１１．７３亿元新台币。如承认大陆学历、开放大陆招生，还可以在相当程度上减轻台湾高校的财务负担。