南澳岛位于粤闽台交通要冲,是广东离台最近处、海上丝路之重要节点、著名台乡。明万历四年(1576)建南澳镇城设总兵府,辖闽南、粤东水师,后派班兵轮守台澎至清结束,曾数次派水师赴台镇压叛乱和抗日保台。郑芝龙、郑成功父子和刘永福也曾屯兵于此。经国台办批准,在总兵府设两岸交流基地。