台湾《联合报》民调结果显示，马英九两岸政策方面的表现最受肯定。有44.9%民众称满意，39.6%民众不太满意，其他方面约15%。台湾淡江大学大陆所所长张五岳指出，如今两岸关系和台海和平趋于稳定，民调反映了这个结果。
台大政治系教授王业立指出，马英九两岸政策表现与历次民调结果一致，显示民众对马英九推动两岸交流等，持正面态度。
王业立更认为，两岸交流进入深水区，会有很多瓶颈；民众对于政治谈判并没有太多共识，加上马英九也没有意愿，因此不急着推动。
不过，台大经济系教授林建甫认为，五成七民众主张两岸要继续扩大交流，远超过认为不必要的三成二，因此当局可以大胆地扩大两岸交流。
台湾中山大学政治所所长廖达琪表示，菲船射杀台湾渔民事件，挑战了马英九的外事能力；此事件发生在民调之后，否则以马英九最初未掌握状况，反应不够明快来看，想必对马英九的满意度雪上加霜。
王业立也认为，一开始马英九反应不很强烈，民众并不满意；直到11日晚才发出强烈声明，未来马英九的处理方式，是否提升民众满意度，仍待观察。
张五岳则说，现在民众期待当局升高对菲律宾的压力，还有很多情绪性的想法，但马英九必须考虑台湾利益，而且王牌也不能一次出尽，所以当局的做法一定与民众的情绪反应有些落差。
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