1990年9月11日，在金门战地的晨曦中，一场因两起遣返船难事件引发的秘密会谈、一次为后来两岸事务性商谈树立经典模式的谈判，正悄悄地举行，从此开启了两岸会谈的历史帷幕。
9月12日，《金门协议》在金门签署，开创了两岸会谈的模式，两岸携手共同打击犯罪掀开了崭新的一页。
背景
两岸自己的事情不要到别人家谈
两起悲剧，两岸商讨改进的办法。在哪里商谈？大陆反对在第三地，郝柏村敲定在金门
1990年发生了两起海上惨案。7月22日，台湾当局将渡海入台的大陆同胞装进渔船底舱遣返，用6寸长钉钉死，25人被闷死在船舱。8月13日，台海军押送福建渔船驶回福建，军舰与渔船相撞，遣返的人中有21人溺毙。
据乐美真披露，两起惨案之后，两岸红十字组织频繁互通电话，商讨今后改进之法，也在探索见面商谈的渠道。继台方提出“中线交接”“、第三地研究”的思路后，双方的联系进入了实质性探讨。大陆提出自己的看法，“两岸自己的事情，不要到别人家去谈”。
陈长文透露一段秘辛，两岸协议敢选定金门签署，是时任“行政院长”郝柏村的果断提议。
陈长文回忆，当双方同意谈判时，在一个星期天，他打电话向郝柏村报告进度并提及正在考虑谈判地点问题，郝柏村问：“为什么不到金门来？”但1990年是“动员戡乱”时期，金门是战地，大陆红十字会的朋友理应多是共产党员，“在金门和共产党接触”涉及“叛乱”，是何等“危险”的事。陈长文当时追问：“院长，是真的吗？”郝柏村在电话另一头说：“为什么不可以？”他转念一想，金门机密且隐秘，确是谈判好地方，他再问一次：“院长，您确定？”郝柏村马上回答：“当然！”1990年9月1日晚，台湾方面表示，双方可以在金门会谈。
时任台军金防部司令的李祯林指出，1990年8月底接获军方密令，表示两岸将在金门会谈，一切行政支持都由金防部负责。当时上层还亲自致电指示细节，强调两岸会谈非同小可，“务必力求隐秘”。
