据新加坡《联合早报》报道，菲律宾卫生部紧急管理部门和医疗人员12日进驻洪灾重灾区，严防各种传染病爆发。菲律宾日前洪灾死亡人数已增加到85人。
菲律宾国家减灾管理委员会表示，首都马尼拉大部分地区的积水已退，但多座水库持续泄洪，附近省份许多区域还泡在水里。
红十字会秘书长彭格温德琳表示，水退后留下遍地垃圾，导致环境卫生成了重大问题。红十字会已经在收容中心和灾区派驻卫生管理员，因为传染病随时可能爆发。红十字会在灾区设置大水槽盛装干净的水，当地官员也在各疏散中心安置流动公共厕所并提供粮食。
菲民防部长拉莫斯表示，目前还有约77万灾民，其中超过一半住在设备不足的948个疏散中心。这些疏散中心原本多是学校或教堂。他警告，由于很多地方积水不退，可能导致钩端螺旋体病(Leptospirosis、俗称鼠尿病)及其他传染病的传播。
一旦爆发疫情，死亡人数可能进一步升高。钩端螺旋体病透过受鼠尿污染的污水传播，潜伏期长达一周。
根据菲律宾政府与世界卫生组织的资料，马尼拉在2009年发生大水灾时，有超过3300人感染鼠尿病，其中249人不治，是菲律宾历来最严重的鼠尿病疫情。
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