埃及已经迎来近60年来首位没有军方背景的伊斯兰派总统，而这并不意味着变革的“尘埃落定”。中国中东问题专家在接受中新社记者采访时指出，民选总统的诞生标志着埃及政治过渡进入重要阶段，以“穆斯林兄弟会”(穆兄会)为代表的伊斯兰派势力与以埃及军方为代表的世俗力量的深层次较量，以及中东北非变革中伊斯兰派势力“夺取政权”之路“拉开大幕”。
穆尔西胜选首日与过渡政府总理詹祖里和武装部队最高委员会主席坦塔维举行会谈。各方分析早已指出，以穆兄会为代表的伊斯兰派、军方和世俗派力量角力仍充斥各个角落。军方此前撤销议会、收回立法权更令舆论称穆尔西为“跛脚总统”。25日的会谈中，坦塔维表示，将与合法民选总统保持合作，维护国家稳定。
中国国际问题研究所副所长董漫远指出，军方既允诺 “还政于民”，又势必要对伊斯兰势力有所制约。未来伊斯兰派势力与世俗力量的深层次较量将“以法斗争”；“法”指埃及国家宪法。董漫远指出，目前军方的唯一办法就是“控制制宪委员会”，通过“修宪”来限制总统权力、对国家性质加以界定并授予军队捍卫国家性质的权力，即通过宪法规定埃及不能走向“政教合一”的伊斯兰原教旨主义国家。
穆尔西身后的“穆斯林兄弟会”显然远比他本人受到关注。董漫远指出，由于穆斯林兄弟会本质上伊斯兰原教旨主义思潮与运动的性质，其掌控国家权力必然会招致埃及军方、国内世俗政治力量和美国等外部力量的高度警觉。而穆兄会之所以能走到权力巅峰，得益于其中带有伊斯兰温和改革倾向的势力在革命中迎合了群众利益的诉求。刚刚当选总统的伊斯兰派会把巩固政权作为“首务”，继续坚持选战中的一些口号，如依法治国、推进不同宗教间的和解、尽快恢复国家经济、民生等，不会很快走向激进。
北京大学国际关系学院教授、中东问题专家王联则指出，过去一个世纪以来，世俗派力量和坚持以伊斯兰教法治理国家的伊斯兰力量一直在角力。如今与其担心穆兄会“最终会露出原教旨主义的尾巴”，不如将其视为一股“政治力量”而非“教派力量”对待。他认为，未来穆兄会将尽全力维持权力，应对国内压力和外部干预。
虽然穆尔西胜选消息传来后解放广场示威民众一片欢腾的画面，很容易让人联想到数月前穆巴拉克政府宣布辞职时的情形，但王联提醒说，如今解放广场示威者多是穆兄会的支持者，最初广场革命中包括青年团体在内的世俗力量已逐渐被边缘化。
王联指出，在大选决胜轮投票中，代表旧政权和世俗力量的前总理沙菲克赢得48%的选票，也反映出人们对穆兄会执政前景“不可靠”感到担忧，所以选择一个前政权高官来领导动荡的国家。另外还需注意到，大选只有51.8%的投票率，近半民众对政治角力已经“不感兴趣”、“不报希望”。穆尔西也并不讳言，埃及社会目前正面临“严重分裂”，他呼吁所有民众冰释前嫌，实现社会和解。
动荡尚未平息，政治角力会不会引爆“二次革命”？专家普遍认为，埃及短时间内不会发生剧变，但将经历长期的政治动荡和过渡期。目前，以美国为首的外部力量意识到伊斯兰派力量崛起的势头已无法遏制，不得不在“并不完美”的情况下，接受、鼓励、拉拢埃及成为民主变革的“成功样板”，继续维持埃、以关系，配合美国的中东战略。
美国总统奥巴马第一时间电贺穆尔西，强调美国支持埃及向民主过渡，在互相尊重的基础上紧密合作，而穆尔西在胜选演讲中表态“尊重所有的国际条约和协议”、“告诉世界，我们想要和平”等举动，被分析为双方的“信心喊话”。
对地区其他国家而言，穆兄会的胜利也为伊斯兰派扩展社会基础、登上政治舞台、最终“夺取政权”树立了“样板”。正在经历变革的阿拉伯世界，未来仍难言平顺。
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