6月16日至17日，埃及举行总统第二轮选举，最终选举结果将于21日揭晓。此次选举如此倍受关注，其中一个重要因素与不久前埃及法院审判了前总统穆巴拉克有关。埃及宪政建设能否走上正轨，以建立一个民主和法治社会正考验着此次总统大选。
6月16至17日，代表伊斯兰宗教势力的穆斯林兄弟会领导的自由与正义党主席穆尔西和代表世俗派力量的前空军参谋长、穆巴拉克时期最后一位总理沙菲克之间为争夺埃及总统的宝座进行了第二轮选举较量。
此次选举约有5000万选民参与投票。虽然此次选举的最终结果还未公布，影响此次选举的因素也较为复杂，但无疑，6月2日埃及开罗刑事法庭针对前总统穆巴拉克等人涉嫌谋杀示威者和腐败案件的一审宣判对此次选举的影响是不容忽视的。6月2日晚，即宣判的当晚，开罗等城市就爆发了大规模的游行示威，抗议审判结果；6月4日、5日，在穆斯林兄弟会和“革命青年联盟”等的号召下，人们又纷纷涌向开罗解放广场抗议法院对审判的不公，6月5日还被定为百万人大游行日；6月8日，开罗解放广场再次爆发了大规模的游行示威，打着“人民不要前政权残余”的口号，以审判结果为导火索，要求废除总统选举中进入决胜轮的前总理沙菲克的竞选资格；6月14日，埃及最高宪法法院作出裁定，认定去年底至今年年初议会选举所依据的法律中的部分条款和旨在阻止前政权高官参政的政治隔离法违宪；6月16日，埃及最高宪法法院作出决定，要求人民议会解散。
有评论指出，原本就充满矛盾的总统选举因为穆巴拉克的审判结果而更加复杂，尤其是最高宪法法院的这一裁决等于给这次选举或者说给埃及政局投下一枚不定时炸弹。但是，审判如何精确地影响此次选举结果却是一个无法证伪的命题，有关观点和评论也是各不相同。尤其是针对穆巴拉克的审判，有观点认为，由于判决太轻，这样的判决会让穆巴拉克集团死灰复燃，因此，在这样的情况下，民众会更多地选择穆尔西，尽管这些选民对穆尔西也不满意，但更害怕前政权的复辟。
还有一种观点认为，由于近期围绕着穆巴拉克的审判，穆兄会组织的游行示威活动超出了抗议的范围，引发了大规模的暴力和混乱，如6月2日晚的游行就至少造成61人受伤，这样追求“安全与秩序”又会成为选民的首要选择，那么沙菲克的支持率必然会上升；此外，还有观点指出，由于大批选民对审判结果的不满会抵制第二轮的选举，事实上在第一轮选举和之前的议会选举中，不少民众就选择了这种方式。
