埃及检方8日宣布，一些美国非政府组织涉嫌非法资助埃及境内团体从事政治活动。同日，埃及总理詹祖里表示，埃及司法主权不可侵犯，埃及不会向任何外来压力屈服。
埃及检方三天前决定将包括19名美国人在内的43名非政府组织工作人员移交开罗刑事法庭审判，此事引起美国方面的强烈不满。分析人士认为，在国内示威活动持续不断的情况下，埃及当局将矛头对准各种非政府组织，可能意在转移视线，但受制于埃美两国数十年来的战略依赖，双边关系不大会出现大的波折，两国将进入一个更加复杂的博弈期。
埃美针锋相对
埃及方面坚称，这些非政府组织未经埃及政府允许就在埃境内开展工作，接受巨额外来资金援助，违反了该国法律。
针对埃及审判非政府组织人员的举动，美国国务卿希拉里·克林顿5日称，埃及此举“不可接受”，并威胁要中止对埃及每年十几亿美元的军事和经济援助。
美国总统奥巴马和国防部长帕内塔也分别与埃及军方最高领导人坦塔维通电话，要求埃方尽快取消对美国公民的旅行禁令。美国参议员约翰·麦凯恩公开宣称，非政府组织争端将全面影响美埃关系。美国参议院对外援助委员会主席帕特里克·莱西更加直接，称“埃及人拿空头承诺换取美国援助的日子要结束了”。
自去年7月以来，埃及安全和检察部门以涉嫌为埃及国内示威者非法提供资金援助为由，展开了一场针对“国际共和政体研究所”等非政府组织的调查。去年12月底，埃及检查人员和安全部队突击搜查了17家非政府组织的办公室。今年1月26日，埃及宣布禁止包括“国际共和政体研究所”埃及分署负责人拉胡德在内的6名为非政府组织工作的美国人离境。2月5日，埃及司法部宣布，将以“未经埃及政府同意非法获得外国机构援助”的罪名起诉43名非政府组织工作人员，其中包括19名美国人。
事实上，埃及政府对美国非政府组织的指责由来已久，在穆巴拉克时代，双方就经常在这个问题上发生争执。
意在遏制示威
分析人士认为，埃及当局之所以拿非政府组织开刀，除它们触犯法律外，还因为这些组织助长了埃及当前愈演愈烈的示威活动。
埃及国际合作部长阿布·纳贾7日说，去年3月至6月间，埃及境内的全部非政府组织共接受约1.75亿美元外来援助，是此前4年援助总额的近3倍。美联社援引一名埃及司法部参与调查官员的话说，一些组织将外来援助用以资助包括“4月6日运动”在内的各种青年组织。而这些青年组织正是埃及去年以来抗议示威活动的主要组织者。
