长江口12.5米深水航道投入运行两年来，通航水深保证率保持在95%以上，吃水12米以上船舶通过量增幅明显，2012年通过530艘次，较2010年增长18.92倍。
2011年5月18日，长江口深水航道工程全面竣工。两年来，长江口航道管理局始终把水深线视为“生命线”，坚持不懈抓维护疏浚管理，确保水深通航保证率。航道水深的持续稳定，带来了大型船舶通航量的持续攀高。海事部门数据显示，2012年通过长江口深水航道的船舶总量为47536艘次，日均149艘次，较2010年长江口12.5米深水航道试通航当年的43041艘次增长了10.44%。交通运输部水运科学研究院统计表明，通航船舶大型化趋势强劲，2012年通过长江口深水航道的船舶平均载重吨已达35477吨。2012年通过长江口的货运量为10.5亿吨，较2010年增长15.4%。长江口深水航道对上海国际航运中心建设发展起到了有力的支撑作用。上海港2012年完成货物吞吐量7.36亿吨、集装箱吞吐量3253.9万标箱，其中有约60%是在长江口内港区完成的。
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