据台湾媒体报道，催生“劳动部”、“卫生福利部”，是台当局这波组织改造关键性变革之一，但组改成效要显现八字还没一撇，千名金融雇员、技术人员能否转任公务员，先引发行政、考试两机构矛盾。若此举真将使公务员退抚激增百亿负担，问题不可谓之不大，且在社会检讨公务人员各项福利之际，这样的转任是否合理公平，更将引来各方聚焦；台当局率开方便之门的后果与效应，当政者恐需细细思量。
回顾组改过程，“考试院”早在组改初始，已清楚反对转任公务员的规划，但“行政院”各单位却碍于人情压力，未正面解决问题，仍在组织法草案罗列可转任条款，最终迫使“铨叙部”通过“立法院”答询出招，演变成“考试院”公开反对“行政院”的困窘局面。
“考试院”以维护公务员制度、财政的完整性出招，先一步站稳立场；对两机构争议被摊开，“行政院”则由业务衔接顺畅着眼，希望诉之以情，与“考试院”沟通。“行政院”相关部会的业务负责人，还曾以“穿着西装改西装”来形容，强调组改过程维持业务不中断，多么难为。
组改当然是艰难的工作，若转换公务员，对制度衔接有必要性，“行政院”应大声为政策辩护；但当舆论气氛开始质疑转任正当性，媒体再追问主张，主管部会或是指“健保局”、“劳保局”早提出完整说帖，避谈评论说帖内容是否合理，或是推称因行政团队改组，所以不清楚过去处理经过。政院的隐讳态度，让人摸不清究竟立场为何，但第一时间把争议政策丢给“立法院”定夺，却有如年终慰问金案的翻版。
马台当局执政以来，一直挥舞改革大旗，誓言追求公平正义，各方虽有批评，但多质疑改革的时机、方法，不曾否定改革的理想。然而组织改造推动至今，已出现业务衔接失调、变动部会单位各显神通争取自身利益等乱相，“健保局”、“劳保局”人员争取转任公务员，只是冰山一角，若“政院”无法抗拒各方人情压力，让台当局愈改造愈庞大，则各方对台当局施政的评价，将绝不只是“有感”、“无感”的差别而已。
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