当年台大毕业、投笔从戎的台湾陆军前上校陈宪良，受林毅夫案波及，军旅不顺遂。图片来源：台湾《联合报》
据台湾《联合报》报道，台湾军方人士指，当年林毅夫离台后，军方明知实情仍以失踪结案，并于一年后宣告死亡，还依法发放抚恤金给他的家属。报道称，林毅夫的同袍（升迁受阻，长官在军中发展前途各异。
据指出，除了林毅夫，多年前以上校阶级退伍、且一样是台大学生转考陆军官校的陈宪良表面上虽然没有受到影响，但他却被台湾军方暗中列为“重点考管人员”，表面上升迁与一般军官没有不同，但只要有机会担任机敏职务或是参加受训，常有无形的阻碍。
尽管没有处分，但林毅夫当年军中长官的发展因人而异，他的营长侯金生于案发后三个月退伍，理由是生涯规划；旅长薄荣萍宦途在往后几年离开台湾陆军，转往台湾警备总部体系发展，以中将阶级退役；师长周仲南反倒是一路历任“总统府侍卫长”、“宪兵”司令与警备总司令，以二级上将阶级退役。
