海协、海基两会是两岸当局的授权管道，所以两会关系是两岸关系的最具体反映。台湾《中央日报》网络报今日刊载点评文章表示，两会关系是基于两岸的“九二共识”，目前朝野两党对“九二共识”的认同与否完全相反，因此，一旦明年政党又轮替，两会关系就势必回到过去曾经发生过的停滞状态。
不妨检视2008年5月国民党重新执政以来，海协、海基两会的互动绩效。从那时起到今年10月底，海基会组团赴大陆参访22次，海协会组团来台10次，共32次。而在2004年11月到2008年4月，双方的互动是零。
点评指出，2008年5月以来，海基会接待大陆来台团体551团，还接待海外团体349团，总计900团。而在2004年11月到2008年4月，连一个访问海基会的大陆团体都没有，同一期间，来访的海外团体仅13团，这是因为两岸关系紧张，海外人士来访意愿降低。
2008年5月以来，海基会接到海协会函3541件，而在2004年11月到2008年4月，只接到23件，亦即在等量的时间里，国民党执政是民进党执政的154倍。
2008年5月以来，大陆人士赴台观光是273.8万人，而在2004年11月到2008年4月，仅28.8万人；前者比后者成长了851％。两岸直航方面，国民党重新执政以来，两岸飞行了74000个航班。而上一次民进党执政期间，两岸之间仅飞行了数十个节日直航航班。
点评指出，台湾民众所重视的两岸共同打击犯罪方面，2008年5月以来，大陆遣返台湾通缉犯151人；两岸合作侦破51案，逮补嫌疑犯3027人。而上一次民进党执政期间，大陆遣返的台湾通缉犯仅仅数人。
至于两会领导人的协商签约，国民党重新执政后的两岸两会商谈共计7次，签署了16项协议。而上一次民进党执政期间，两会领导人见不了面，也未曾签署协议。除非有人认为上述两会积极推动互动对台湾不利，否则两会互动不仅是所有台湾民众所支持，也是国际社会所乐见。而认同“九二共识”与否的政党执政，则决定两会是否能有正常往来。
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