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据台湾“今日新闻网”报道，台大医院创伤医学部主任、挺陈水扁医师柯文哲，因爱滋器官捐赠案遭公惩处分，妻子陈佩琪跳出为丈夫喊冤，引起外界关注。夫妻俩缘起台大医学院，当时住在同栋宿舍，却从没见过面，有次柯妈妈见到她，直对儿子说：“这个好，适合当老婆。”接着更主动帮忙要电话，让两人进而认识交往。
柯文哲说自己不浪漫，当时在医院一起吃便当就算约会，交往短短几个月便互许终生，连自己怎么求婚都不记得。同为医生的陈佩琪，负责处理家中大小事，柯文哲谈及此哽咽道：“儿子患有亚斯伯格症，但我很少带他出门、跟他讲话，这些年来全部都是太太一肩扛下家庭责任，让我可以专心工作。”
感谢老婆挑起重担，日前他透露，自结婚起，存折、印章都让太太“没收”，只有受邀演讲时领的现金，偶尔能偷偷存起来当私房钱，不忘强调因没时间跑银行，交给妻子放心也省事。陈佩琪曾打趣向他说过：“你要离婚的话，只有身上穿的衣服是你自己的，其他全部都是我的。”
父亲不赞成他选台北市长，父亲个性很沉默，“228事件”时父亲14岁，阿公是老师被捉去关，回来变残废，卧病3年过世。柯文哲到现在才明白“228事件”对其伤害多深，当报道传出他欲参选风声，80多岁老父就会搭客运从新竹北上想劝退他：“不要选，当医生好好的就好。”究竟是否参选？他语带保留：“我有在想，有在准备。”
