台湾当局推动建立两岸军事互信机制转趋保守，有学者分析，除了两岸缺乏政治互信，台湾内部缺乏共识也是原因，但主要原因在于马英九担心美国将因此减少、甚至中止对台军售，因此改变立场。
台湾《联合报》报道，美国乔治华盛顿大学的席格亚洲研究中心27日举办研讨会，讨论两岸建立军事互信，邀请“战略暨国际研究中心”研究员葛来仪、“史汀生中心”东亚研究室主任容安澜和台湾淡江大学战略所副教授李大中等人与会。
李大中表示，台湾从1990年代就提出建立两岸军事互信机制的构想，大陆也多次提出类似建议，但至今未取得进展，“主因在于两岸政治互信不足”。
李大中指出，和以往相比，目前台湾讨论建立两岸军事互信机制相对保守，因为这项议题复杂且具政治敏感性，台湾内部缺乏共识;加上两岸对此设定的目标也不同，大陆认为这是促成两岸统一的重要因素，台湾则着重其功能性，且认为不应做为政治谈判的前提。此外，当局不希望美方认为台湾过度“倾中”，还牵涉军售议题，因此立场转趋保守。
葛来仪则指出，马英九在连任前支持两岸签署和平协议和建立军事互信机制的可行性，选后立场却明显转变，除了内部缺乏共识，最重要的是“美国因素”，因为马英九担心美国将减少、甚至中止对台军售。
此外，马英九认为“北京想利用军事互信机制让台湾更不安全、伤害台湾的利益”，因为大陆始终不愿意减少对台湾的军事威胁。加上马英九认为两岸应先签署和平协议再谈军事互信，因为在缺乏政治互信前提下，讨论军事和安全议题太不成熟，但目前签署和平协议的时机还太早。
葛来仪说，北京认为军事互信机制的目的在建立互信，以达到统一的目标，北京无意让现状长久化，但台湾目前仍希望“维持现状”，造成两岸间极大差异。
