马英九10月17日将接任国民党主席，对两岸关系发展有何影响？台湾大学政治系教授、台湾政策研究基金会内政组召集人萧全政接受香港中评社专访时表示，在“党政合一”的效应下，两岸关系发展也会比较正常化。只要大陆够务实，易引起争议的问题就可搁置，并且顺利完成两岸经济合作架构协议（ECFA）的签署。
外界担心马英九10月17日接任国民党主席，两岸和平发展的模式可能会有变化。对此，萧全政表示，马英九接党主席对台湾内部立即的效应就是“党政合一”。这对国民党政权而言，可以提升其内部团结，“党政合一”也意味着党会更直接面对民意，尤其是绿营的制衡。在这种挑战下，将来两岸关系的发展，国民党会相对弱化，国共平台确实可能会因而受影响。
有关吴敦义与朱立伦担任“行政院正、副院长”的“内阁”改组，这对两岸有何助益？萧全政表示，吴敦义、朱立伦都具备两岸大局观，这对两岸关系的未来发展，具有正面的意义。但是两岸关系的发展，基本上并不因为个人因素而决定，仍然要看两岸之间的大环境，及大陆的整体态度而定。
对于民进党籍高雄市长陈菊邀请达赖赴台后又出招，将在2009高雄电影节将放映“疆独”头目热比娅的纪录片《爱的十个条件》，此举是否会影响两岸关系发展？萧全政认为，从整体角度看，要说没有影响那将是骗人的，但是基本上大陆是非常务实的，影响也应该是非常的有限。
他表示，大陆向来对分离主义、极端主义，及恐怖主义的警觉性都非常高，因此，达赖与热比娅的话题，可以说，是直接冲击到大陆最禁忌、最紧绷的神经。两岸其实也必须多利用这些机会，增加对双方立场与实际情况的了解，才能在和平中发展两岸之间的关系。
至于“吴内阁”是否有助年底县市长、县市议员及乡镇市长选举？萧全政表示，许多人对于这次“内阁”在两天之内就完成改组，都有耳目一新的感觉；但是，他们对于年底三合一的选举能有多少助益，仍然要看他们未来的表现。若是“吴内阁”的政务没有耳目一新、没让大家放心，那还是选不下去。
萧全政指出，“吴内阁”的“阁揆、副阁揆”都曾担任过地方或“中央”的民意代表或“行政首长”，都有直接接触选民的经验，故比较了解民瘼。他们对廉能的强调，都与马英九一致，默契也很直接；两人也都非常注重效率，而被视为“行动内阁”或“效率内阁”，这是正面特质，也是优点。但其负面影响，就是太强调廉能、效率，可能引来绿营或立法部门的强烈对抗，这是“吴内阁”必须注意的地方。
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