实际上，民进党原来所设的“中国事务部”是一个专门面对大陆的部门，负责民进党与大陆联系的事务，也是一个十分敏感的部门。其负责的业务有：有关“中国事务”工作的推动、联系与协调事宜，有关“中国事务”信息的搜集与分析事宜，有关台湾安全及战略研究事宜。就在颜建发出任“中国事务部主任”之时，也正是“中国事务部”业务最为兴盛之时，由“中国事务部”主编及出版并由颜建发任总编辑的《中国事务季刊》办得有声有色。《中国事务季刊》是民进党第一本从事政策研究讨论，又定期出版的学术刊物。当时创办此刊物的目的是期望针对大陆及海峡两岸的各项议题进行客观中立的政策研究。《中国事务季刊》在其创刊号中自我期许应具有“三性”，其一是“学术性”，亦即是具有一定政策指导性的学术性刊物，因此文章首先应立足于中立、客观的基础上，然后才考虑政策指向、舆论引导的作用；其二是“针对性”，亦即其研究范畴偏重于两岸关系的近期发展，特别是特定时期下特定形势的方方面面的分析，以及对两岸关系的长远设想，和大陆内部状况的分析及介绍；其三是“包容性”，亦即该刊虽是由民进党所出版，但并不要求作者削足适履的揣摸该党两岸政策的目标与限制，不但欢迎站在该党或台湾立场的剀切建言，也欢迎基于岛内外其它政党、利益团体的不同意见；既欢迎针锋相对，也欢迎读者提出响应和挑战。实际上，在其创刊号的8篇文章中，就有4篇来自海外，3篇来自大陆，分别由徐博东、林毅夫、叶自成探讨陈水扁的“新中间路线”、中美关系的互动及其对两岸关系的影响等问题。
《中国事务季刊》的订户遍布世界各地，除了台湾地区和大陆的众多读者之外，从韩国的汉城国立大学，到美国的柏克莱加州大学、史丹佛大学胡佛中心、芝加哥大学、普林斯顿大学，到加拿大的多伦多大学，以至英国的牛津大学、爱丁堡大学，再到以色列国家大学，都是该刊的订户。因此，《中国事务季刊》曾成为岛内外最重要的大陆研究刊物之一。但在2007年7月，民进党却声称为配合精简人事和组织改造，并促进“台、中关系”正常化，将“中国事务部”与国际事务部合并，是为成为“国际关系事务”之一。两部合并后，使用国际事务部的称谓，并将其职能范围定位为“国际关系”。这是秉承自陈水扁“一边一国论”，亦即将两岸关系视为“国与国关系”的思路，并配合当时的民进党当局所进行的一系列“去中国化”活动，与“台独联盟”创办人蔡同荣提出的将“陆委会”归并进“外交部”的主张如出一辙。当然，也有“精简机构”的考虑。现在颜建发建议设立两岸关系部，就含有对陈水扁、游锡堃当时此举的强烈不满。
实际上，颜建发是民进党中的“鸽派”，主张进行两岸交流，他是2000年陈水扁上台后，在民进党中央政策会政务副执行长任内调任“中国事务部”主任的。2002年7月，陈水扁兼任民进党主席，声称要与大陆进行交流，委任“中国事务部”的创办人陈忠信回任“中国事务主任”，颜建发“降”为“中国事务部”首席副主任。2004年，颜建发进入公职，先后出任“外交部”研究设计委员会副主委、主委。陈水扁下台后，颜建发任清云科技大学企业管理学系教授兼国际合作处处长。
[责任编辑：赵静]
京ICP证130248号京公网安备110102003391