1998年11月12日――孙中山先生诞辰132周年纪念日,顶新集团又与宋庆龄基金会合作,创立了“顶新专项基金”。主要用于资助海峡两岸妇女、儿童的交流活动及中国少年儿童福利事业。
“顶新基金”成立伊始正值长江流域遭逢百年未遇的特大洪水。顶新基金管委会立即决定向九江市的湖口县、九江县捐赠了2500套课桌椅。同时又开展为希望小学送图书活动,从1998年到2002年的5年内向全国贫困地区的1000所中小学捐赠1000套优秀儿童图书。首批捐赠图书共计100套,每套约850册,河北、四川及山东等地区的100所学校受到捐助。