据台湾《旺报》报道，对于菲国公务船滥杀台湾渔民一事，引发大陆强烈关注。大陆学者发现，台湾方面在海洋权益的维护上，能力走向日薄西山，两岸应共同合作，进行海洋维权。
中国人民大学国际关系学院教授时殷弘指出，菲国的蛮横作为引起两岸极大愤怒，只会恶化菲国和两岸的关系，最后促成两岸加大对菲国在海洋权益上的斗争力度。
华东师范大学国际关系与地区发展研究院副教授包承柯说，即便台湾军事力量维持在一定水平上，但再过10年，台湾应变海洋紧急态势的能力在下降；海洋管理维权能力也在削弱，如此一来，台湾当局如何维护海洋经济权？他说，冷战时期，该区域的海洋纷争都是靠美国来做调解，但未来的区域经济权利问题上，美国未必介入。
包承柯建议，大陆和台湾可以在海洋维权的问题上，达成一些合作或共识，如此正好能弥补台湾在处理海洋管理问题上不足的需求。
