1月

1日 陈水扁在元旦讲话中称，将以“积极管理、有效开放”作为两岸经贸政策的新思维与新作为；期许2006年产生民间版的“台湾新宪法”草案，并在社会条件成熟的情形下于2007年举办“新宪公投”。

5日 马英九接受专访时称，“台独”不是国民党的选项，“法理台独”是破坏两岸现状，泛蓝绝不会分裂，“修宪”暂不必要，“国民党将以在野力量，加速推动两岸直航”。

11日 陈水扁声称，台当局会“全力加速推动各项海巡建设，强化维护海域和海岸的安全”，“以早日实现捍卫海洋、经营海洋和走向海洋的海洋国家愿景”。

14日 国民党发布新闻稿指出，基于“一中宪法”和“国统纲领”的精神，国民党不追求“法理台独”。

15日 前“总统府秘书长”游锡堃当选为民进党主席，26日就职。

19日 陈水扁宣布前民进党主席苏贞昌担任“行政院长”，前“陆委会主委”蔡英文任“行政院副院长”，“行政院副秘书长”刘玉山升任“行政院秘书长”。

24日 前民进党主席林义雄宣布退党。

25日 国民党中常会通过“党员参加公职人员选举提名办法”修正案，规定未来需入党满4个月才能登记提名。

29日 陈水扁借春节谈话提出三大诉求，一是主张“废除国统会及国统纲领”，二是“今年内将台湾新‘宪法’定稿，明年举办‘新宪公投’”，三是希望以“台湾”为名“申请加入联合国”。

2月

7日 国民党主席马英九在《亚洲华尔街日报》上发表文章称，“在可预见的未来，统一或‘独立’都不太可能，我们应该维持现状”，“台湾的未来，应该由人民决定，而非‘政府’”。

10日 第七届“区域立委”单一选区的席次分配名额确定，全台“一级战区”的台北市、台北县各分配8席、12席，桃园县、高雄市各分配6席和5席。

15日 国民党主席马英九强调，“‘台独’绝非国民党的选项”，国民党的选项是“维持现状、等两岸达到自由民主均富的条件下，在台湾人民同意下推动两岸统一”。

16日 民进党主席游锡堃宣称，未来民进党所提“新宪”版本可能触及“国旗”、“国号”与“领土”议题。

27日 陈水扁主持“国安”高层会议，决定终止“国家统一委员会”运作和“国家统一纲领”适用。

3月

1日 台湾各县市议会正副议长选举结束，国民党拿下23个县市中17个议会议长。

2日 美国务院发布书面声明要求台当局“毫不含糊的确认‘国统会’没有废除”。 6日，美国务院一位资深官员强调，陈“依然要毫不含糊地再公开说明（‘国统会’依然存在）”。

3日 陈水扁称，“‘宪改’工程会按照程序进行，2008年前制定新‘宪法’很难，但是并非不可能”。

6日 台“行政院长”苏贞昌称，“台湾绝非中国的一部分，统一并非唯一选项”。

7日 马英九称，“维持现状对台湾最有利，经济政策应是台湾的优先课题”，陈水扁的“终统”“可能是片面改变台海现状的第一步，将影响台美关系”。

11日 嘉义市举行“立委”补选，国民党候选人江义雄当选。

12日 国民党在台北市举行以“人民做主拚生活，统‘独’休兵救台湾”为诉求的大游行。

14日 民进党完成“宪改草案”版本，“暂不处理‘国号’、‘国旗’及领土变更等议题”。

18日 “台独”团体“民主和平护台湾大联盟”举办“护民主、反并吞”大游行。

19日 陈水扁下令拆除所有军事营区内蒋介石、蒋经国铜像。

4月

3日 马英九与陈水扁举行“扁马会”，但没达成任何共识。

7日 陈水扁亲信、前“总统府副秘书长”陈哲男因“政治献金弊案”被收押。

19日 民进党秘书长林佳龙宣称，民进党的“宪改草案”不会触及“变更领土、国旗、国号”等敏感议题，只会“修改、整合‘宪法’本文及增修条文”。

民进党中常会通过决议，取消“行政部门及公营事业从政党员须募款一定责任额”的规定。

25日 “二十一世纪宪改联盟”公布第一版完整的“宪法草案”。

5月

3日 国民党中常会就“宪改”议题达成共识，采取“遵宪、行宪，不修宪”立场。

15日 台当局抛出首份所谓“国家安全报告”，大肆鼓吹台湾“主权独立”，恶意煽动“中国威胁论”。

21日 亲民党主席宋楚瑜与马英九举行“马宋会”，达成反对“修宪”与不参加“经续会”的共识。

6月

3日 亲民党在台北市举行“全民呛扁”游行。

7日 马英九下令启动罢免陈水扁机制。亲民党主席宋楚瑜表示，不管是“罢免”还是“倒阁”，“亲民党都可以接受”。

10日 台湾举行基层村里长选举，国民党拿下2197席，民进党125席；亲民党、“台联党”、新党等席次极少。

12日 “泛紫联盟”宣布解散。

国民党中央党部正式从中山南路大楼搬往八德大楼。

17日 泛绿阵营在台北市、高雄市和台南市等地共同发起“挺扁”大集会，发表“保卫本土民主政权”的行动宣言。

岛内“急独”势力以“北社”等“台独”组织为基础，串联海外“台独”社团，成立新的“台独”组织“台湾社”，李登辉任“荣誉总社长”。

24日 国民党主席马英九表示，国民党在“罢免案”表决后将回到温和、理性的轨道；未来不再举行大型街头运动，倾向不提出“倒阁案”。

27日 “立法院”记名投票“罢免案”，因未达全体“立委”三分之二的“宪法”门槛，未通过“罢免案”。

29日 陈水扁提出未来台湾发展的“两大主轴”及五个面向。他强调，“将在既有的民主成就基础上，持续营造更开放的政治环境与更透明的‘政府’决策，共同推动‘宪政改造’工程”。

7月

5日 民进党中常会成立防范泛蓝“倒阁”因应小组，党主席游锡堃任召集人。

9日 民进党主席游锡堃称，民进党有意与“台联党”等共组“绿色公义联盟”。但“台联党”表示“不可能跟陷入贪腐、弊案的民进党谈合并”。

10日 台北“地检署”侦结台开内线交易案。陈水扁女婿赵建铭、亲家赵玉柱分别被求刑8年、10年。

15日 亲绿学者发起“倒扁”连署声明，呼吁陈水扁为贪腐辞职下台。

16日，陈水扁宴请多位“独派”大老寻求支持，承诺未来两年会认真推动包括“制宪”在内的2004年竞选政见。

16日 “群策会”抨击台当局的“经续会”“背离本土、向中倾斜”。

21日 陈水扁发表“民主困境与政治道德”声明，表示“没有宣布请辞下台或退党意愿”，强调“会做到2008年任期结束”，引起社会各界一片挞伐。

22日 民进党召开为期2天的“全代会”，陈水扁未参加。“泛苏系”联盟在中执委、中常委、中评委选举中大获全胜。该会还通过“廉政条例”、解散派系等提案。

民进党中执会启动“立委”选举暂行提名机制，通过提名7人小组名单。

29日 国民党举行中常委选举。

8月

5日 吕秀莲成立“蓝天绿地好台湾”联盟。

9日 前民进党主席施明德致函陈水扁，呼吁陈“勇敢认错，鞠躬下台”。

12日 陈水扁在为“凯达格兰学校”授课时称，将推动以“台湾”名义申请加入联合国、把中正机场正名为“台北国际机场”、催生“新宪法”版本等“台独”议题。

13日 李登辉宣称，未来台湾社会应该以“台湾主体政权”一词取代“本土政权”的说法。

16日 台2006学年高中历史审定本教材纳入“台独”人士奉为“台湾地位未定论”重要法理基础的《旧金山和约》和《中日和约》。

22日 国民党首次公布党产报告。

9月

9日 “百万人反贪腐倒扁静坐运动”正式登场。

14日 陈水扁通过越洋视讯会议向国际社会表示，台湾要“认真思考透过公民投票方式，以台湾名义、新会员身份直接申请加入联合国”。

20日 李登辉提出“虚位元首内阁制”方案。

22日　基隆市长许财利被判7年有期徒刑，国民党开除其党籍。

24日 陈水扁宣称，台湾现行“宪法”中的“固定疆域”与现状完全脱节，“应认真思考，予以必要处理”。民进党表示会把陈“变更领土范围”这一“宪改”议题纳入“宪改”版本。

27日 民进党“世代论坛”发表声明，表示不接受陈水扁作为“政治上的领导者”。

28日 民进党举行创党20周年纪念活动。

10月

4日 民进党中执会依党务系统研拟的“宪法修改草案”，提出“台独党纲版”、“台湾前途决议文版”与“不动宪法总纲版”等3个版本。游锡堃宣称，他个人主张“总统制和台湾国”。

10日 “倒扁”总部发动“天下围攻”活动。

13日 “二次罢免陈水扁案”失败。

15日 陈水扁在“台独”分子辜宽敏的生日宴会上，宣称要冻结现有台湾“宪法”，“制定符合台湾现状的‘第二共和国宪法’”。

16日　苏贞昌称，推动官营事业“正名”是要与大陆区隔清楚，“各相关官营事业只要认为有必要，经评估可‘正名’，就可报经‘行政院’核定执行”。

25日 “行政院”通过首例“去中国化”法律修正案，将现行“民法总则”及“施行法”中有关“服从中国法律义务”等字眼删除。

31日 民进党成立“讨党产大联盟”。

11月

1日 国民党“党产处理监督委员会”成立。

2日 陈水扁在接受英国《金融时报》专访时再次宣称，台湾可以“冻结”现行“宪法”，并通过一部“新宪法”，其序言将厘清台湾“疆域”范围。

3日 “国务机要费案”侦结。吴淑珍、前“总统府副秘书长”马永成等人涉嫌贪污及伪造文书罪被起诉。

4日 泛蓝阵营发起为期两天的“促扁下台”的游行活动。

5日 前“总统府秘书长”陈师孟公开表示，不支持陈水扁“坚持下去”。

8日 民进党召开第二次扩大中执会，就“机要费”后续若干问题达成三点决议，包括尊重陈水扁“一审有罪就下台”的决定，反对第三次“罢免案”、违者党纪处分等。

9日 “独派”色彩浓厚的前“国政顾问团”成员、义美公司总经理高志明表示，建议陈水扁“自动请辞”。

前“中研院院长”李远哲发表公开信指出，陈水扁与民进党必须在“小我”与“大我”之间做出正确的抉择，建议陈水扁有必要慎重考虑去留问题。

10日 周玉蔻因支持第三次“罢免案”违反“台联党”决议，被开除党籍。

13日 民进党“立委”、前新潮流系成员林浊水、李文忠宣布请辞“立委”，以表达对陈水扁和党中央处置“国务机要费案”的不满。

国民党荣誉主席连战与“立法院长”王金平及10多位党内本土派“立委”餐叙时，建议在野党“组阁”。

14日 台北市长候选人宋楚瑜称，他和亲民党不会卷进2008年的权位之争。

18日 陈水扁在出席“宪法原住民族专章”学术研讨会时说，“宪法”应制订原住民专章，作为建构新“宪法”的核心价值之一。

24日 第三次“罢免案”闯关失败。

28日 陈水扁的子弟兵罗文嘉在美国批评，陈在“国务机要费”中“言词前后矛盾，涉及伪证，是很糟糕的事”。

30日 民进党中评会决议，吴淑珍、前“总统府副秘书长”马永成等4人被停权1年6个月。

12月

3日 民进党及“台湾社”等“台独”社团在高雄爱河边举办“爱在高雄，守护台湾”造势活动，陈水扁及吕游苏谢共同参加了活动。

5日 陈水扁会见外宾时表示，目前正研拟“以台湾名义加入联合国”，“未来不会以中华民国、中华民国在台湾、中华民国（台湾）名义申请加入联合国，避免陷入一个中国代表权之争”。

7日 陈水扁到高雄市辅选，鼓吹不能让台湾高雄也变成“中华高雄、中国高雄”，并主张将“总统府”迁到高雄。

9日 北高市长选举结果揭晓，国民党籍郝龙斌和民进党籍陈菊分别当选新一任的台北、高雄市长。

14日 国民党中常会未通过“国亲政党联盟草案”。

14日 民进党提出所谓“释宪声请书”，促法院暂停审理陈水扁涉及的“国务机要费案”。

15日 “国务机要费”案首次开庭审理，陈水扁夫人吴淑珍现身法院应讯，但在应讯90分钟后突然昏倒，送医急救。

19日 台“中华文化复兴运动总会”正式更名为“国家文化总会”。

20日 吕秀莲与“立法院长”王金平均表示，“将共同推动2007年‘立委’选举与2008年‘总统’选举合并举行”

21日 “立法院长”王金平表示，国民党未必只有一组参选2008年“总统”选举。

25日 国民党主席马英九正式卸下台北市长职务，担任专职党主席。

25日 民进党主席游锡堃表示，依照惯例，初拟2007年3、4月间办理“总统”选举党内初选登记，5月党员投票，6月进行民调，7月正式提名。

27日 国民党主席提出未来执政五大愿景。

台北地方法院宣判“台开案”，判处陈水扁亲家赵玉柱有期徒刑8年4月、赵建铭徒刑6年。