1月

7日 马英九在出席台湾日本人会及台北市日本工商会“2009年新年联谊酒会”时称，今年是台湾和日本的“特别伙伴关系促进年”，强调在其任内会好好发展台日关系，建立互信。

8日 台湾“陆委会副主委”赵建民在记者会上表示，由于索马里亚亚丁湾海盗猖獗，台湾正在评估由海军派出军舰，保护台湾商船的航行安全。

13日 “美国在台协会”表示任何船只遇险要求协助美国海军皆有责任提供协助。

13日 世界卫生组织干事长办公室通知台湾疾管局，将台湾纳入世界卫生条例当中，台湾可以直接与世界卫生组织联系。

14日 台湾“监察院”调查“巴布亚新几内亚建交案”发现，前“国安会秘书长”邱义仁、前“外交部长”黄志芳两人“怠忽职守”，导致近3000万美元公款遭侵吞，故分别通过弹劾两人案。

同日，台湾特侦组就“侵占机密外交款案”将前“外交部政务次长”高英茂改列图利被告，并限制出境。

17日 美国贸易代表署宣布将台湾自特别301观察名单除名，对此“美台商会”表示欢迎，认为台湾在改善知识财产权上的进展，是一项“台湾能真正感到骄傲的成就纪录”。

2月

4日 台湾“外交部发言人”陈铭政表示，冈比亚、斯威士兰等非洲4个“邦交国”计划邀请马英九访问，“外交部”将进行评估。

同日 日本外务大臣麻生太郎称，台湾今天拥有较高教育水平，得益于日本的殖民统治。

5日 中国外交部发言人孔泉说，1894年甲午战争后，日本强行侵占台湾，使台湾岛内民众饱受奴役，给中华民族带来了深重灾难，这是世人皆知的事实。日本对台湾长达半个世纪的殖民统治，是日本军国主义侵华历史的黑暗一页。作为加害国外交当局的最高负责人发表上述言论，是对历史的歪曲，也是对中国人民感情的严重伤害。

6日 马英九出席2009观光节庆祝大会时表示，简化签证程序，是吸引观光客最重要的原因，目前台湾正与美方积极洽商互免签证计画，希望拓展双方观光，同时他个人也多次利用接见欧盟国家代表机会，向对方表达互免签证吸引观光客的想法。

6日 台湾“行政院长”刘兆玄在听取“体委会”与台北、高雄市简报“听障奥运会”与“世界运动会”筹办情况后，指示各“部会”全力配合，要求“外交部”突破邀访外宾的人数限制，并加强国际宣传，“向全世界展现台湾打拚精神”。

17日 马英九表示，日本给台湾民众免签证待遇后，带动双方观光人次增加，希望美国也能给予台湾民众免签证待遇。

23日17位美国众议员连署提案，重申“信守《与台湾关系法》作为美国对台湾关系的基石”，“支持台湾民主体制”。对此，台湾“驻美代表处”表达“感激与欢迎”。

26日 中断超过3年半的台、日第16次渔业会谈在台北举行，台湾希望这次会谈能搁置钓鱼岛主权问题，双方获得“共同管理争议海域”、“解决渔业纠纷”的共识。

同日 日本外务大臣麻生太郎在众议院预算委员的一次会议上宣称，将与美国协商把钓鱼岛纳入“日美安保条约”保护范围。中国外交部发言人马朝旭即表示，中方对此强烈不满，已向日方提出严正交涉。

27日 对于麻生太郎的说法，台湾“外交部”予以驳斥，重申“中华民国政府”拥有钓鱼台“主权”。

3月

3日 英国自即日起给予台湾民众6个月赴英国免签证待遇，而台湾自1993年起就开放英国国民来赴台免签证30天。

5-10日 台湾“外交部长”欧鸿炼出访巴拉圭和多米尼加。

16-18日 “美国在台协会理事主席”薄瑞光（Raymond F. Burghardt）访问台湾，会见台湾政商界人士。18日，在拜会马英九和蔡英文等朝野领袖时，对目前台美关系给了“极好”评价，并强调两岸稳定与对话的重要性。

20日 马英九与媒体茶叙时表示，“追求双重承认不切实际、也不是我的目标”，“政府推动参与世卫组织若涉主权争议，解决方案就是‘九二共识’”。

23日 台湾“调查局台北市调处”前往台北看守所，就“侵占机密外交款案”讯问陈水扁。

25日 美国国防部提出中国军力报告，指中国军队仍以台湾为假想敌，部署导弹逾1050枚，逾三分之一重兵部署于台海。

31日 台湾“立法院”审查通过了《经济社会与文化权利国际公约》及《公民政治权利国际公约》两项国际公约。

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